2013年3月5日火曜日

Rのインストール(Ubuntu)

今さらながら、Rを自宅マシン(Ubuntu 12.04)にインストールした。
そのときのメモ。
ちなみに、以下のページを参考にした。
Rのインストール

1.sources.listにパッケージを取得するサイトを追加
$ sudo gedit /etc/apt/sources.list
以下をsources.listに加える。
deb http://cran.ma.imperial.ac.uk/bin/linux/ubuntu precise/
他のサイトを追加したい場合は、CRAN Mirrors

2.Ubuntu レポジトリの公開鍵を入手
以下を実行。
$ gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key E084DAB9
$ gpg -a --export E084DAB9 | sudo apt-key add -

3.最新のパッケージリストを取得
以下を実行。
$ sudo apt-get update
以下のようなメッセージが出てうまくかなかった場合は、1で追加したサイトを変更する。
W: http://cran.md.tsukuba.ac.jp/bin/linux/ubuntu/gutsy/Packages の取得に失敗しました 404 Not Found
W: http://cran.md.tsukuba.ac.jp/bin/linux/ubuntu/feisty/Packages の取得に失敗しました 404 Not Found
W: http://cran.md.tsukuba.ac.jp/bin/linux/ubuntu/dapper/Packages の取得に失敗しました 404 Not Found

4.Rのインストール
以下を実行。
$ sudo apt-get install r-base

5.Rの実行
$ R
で実行すると、
R version 2.15.3 (2013-03-01) -- "Security Blanket"
Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: i686-pc-linux-gnu (32-bit)

Rは、自由なソフトウェアであり、「完全に無保証」です。
一定の条件に従えば、自由にこれを再配布することができます。
配布条件の詳細に関しては、'license()'あるいは'licence()'と入力してください。

Rは多くの貢献者による共同プロジェクトです。
詳しくは'contributors()'と入力してください。
また、RやRのパッケージを出版物で引用する際の形式については
'citation()'と入力してください。

'demo()'と入力すればデモをみることができます。
'help()'とすればオンラインヘルプが出ます。
'help.start()'でHTMLブラウザによるヘルプがみられます。
'q()'と入力すればRを終了します。

>
上記のようなメッセージが出てRを実行できる。

6.パッケージのインストール
以下を実行し、CRANミラーサイトを選択する。
(以下を実行しなくても、install.packagesを実行すると最初に選択することになる。)
chooseCRANmirror()
以下を実行してパッケージをインストール(以下はkernlabをインストールする例)。
install.packages("kernlab")